تتم عملية الانتساب للحاضنة من خلال تقديم طلب أولي للانتساب (pre qualification form) ,حيث يعلن عن موعد التقديم من خلال مسابقة عامة. ويعطي الطلب فكرة ومعلومات مختصرة عن المتقدم ومؤهلاته وخبراته ونوع وطبيعة المشروع المطلوب انتسابه للحاضنة والدعم المطلوب من الحاضنة. وعلى ضوء هذه المعلومات يتم القبول الاولي أو رفض المشروع بواسطة اللجنة الداخلية للحاضنة. وفي حالة القبول الاولي لللمشروع يقوم صاحب المشروع بعمل دراسة جدوى اقتصادية بمساعدة الحاضنة ومن ثم يتم عرض هذه الدراسة على لجنة تسيير الحاضنة(incubator steering committee) لقبول المشروع أو رفضه.

الشكل المرفق يلخص الالية المتبعة في إختيار المشاريع المحتضنة ضمن حاضنة الاعمال و التكنولوجيا في الجامعة الاسلامية.